
期刊简介
《中草药》杂志是由中国药学会和天津药物研究院共同主办的国家级期刊,月刊,国内外公开发行。本刊创始于1970年1月。1992年荣获首届全国优秀科技期刊评比一等奖; 2002年荣获中国期刊方阵“双奖期刊”;2003年1月荣获第二届国家期刊奖(期刊界最高奖);2005年1月荣获第三届国家期刊奖提名奖,2005—2010年连续6次荣获“百种中国杰出学术期刊”;2006年荣获天津市优秀期刊“特别荣誉奖”;2008年荣获“中国精品科技期刊”;2009年荣获“新中国60年有影响力的期刊”和“中国科协精品科技期刊”;2010年荣获“第二届中国出版政府奖期刊奖”(中国新闻出版行业最高奖)。本刊为中国自然科学核心期刊、全国中文核心期刊,位居中药学期刊之首。多年来一直入选美国《化学文摘》(CA)千刊表,并被美国《国际药学文摘》(IPA)、荷兰《医学文摘》(EM)、荷兰《斯高帕斯数据库》(Scopus)、美国《乌里希期刊指南》(Ulrich’s Periodicals Directory)、世界卫生组织西太平洋地区医学索引(WPRIM)、波兰《哥白尼索引》(IC)、英国《质谱学通报(增补)》(MSB-S)、日本科学技术振兴机构数据库(JST)、美国剑桥科学文摘社(CSA/ProQuest)数据库等国际著名检索系统收录。本刊被收录为国家科技部“中国科技论文统计源期刊”(中国科技核心期刊)。经中国科学文献计量评价研究中心和中国学术期刊(光盘版)编委会认定,《中草药》杂志为“中国科学引文数据库来源期刊”和“中国学术期刊综合评价数据库来源期刊”,并由中国知网独家全文收录。本刊主要报道中草药化学成分;药剂工艺、生药炮制、产品质量、检验方法;药理实验和临床观察;药用动、植物的饲养、栽培、药材资源调查等方面的研究论文,并辟有中药现代化论坛、专论、综述、新产品、企业介绍、学术动态和信息等栏目。承蒙广大作者、读者的厚爱和大力支持,本刊稿源十分丰富,为了缩短出版周期,增加信息量,本刊自2011年1月起由A4开本每期168页扩版为208页,定价35.00元。国内邮发代号:6-77,国外代号:M221。请到当地邮局订阅。如有漏订者,可直接与本刊编辑部联系。欢迎广大作者踊跃投稿,欢迎广大读者订阅,欢迎与中外制药企业合作,宣传推广、刊登广告(包括处方药品广告)。中草药杂志社网上在线投稿、审稿、查询系统已开通,欢迎广大读者、作者、编委使用。
SCI写作暗黑周记:当癌症基因组分析遇上导师的“再来一版”
时间:2025-07-08 17:44:25
这周实验室的咖啡机又罢工了,而我的论文修改方案也像那台老机器一样,在导师的“温柔建议”下彻底卡壳。事情是这样的:上周我兴冲冲交了一版癌症基因组分析的结果,导师扫了一眼说:“数据量不够,实验设计得重来。”——这句话的杀伤力,堪比PCR跑胶时发现引物二聚体比目的条带还亮。
一、实验设计的“俄罗斯套娃”困境
生物信息学的实验设计,本质上是在玩一种叫“既要又要还要”的套娃游戏。比如我的课题:从TCGA数据库扒拉三阴性乳腺癌的RNA-seq数据,比较癌与正常组织的差异表达基因。听起来简单?但导师的要求是:“样本量再扩大,对照组再加一组炎症组织,顺便把甲基化数据也整合进来。”——这感觉就像点了一碗牛肉面,结果老板端上来满汉全席的食材清单。
TCGA数据库确实强大,33种癌症基因组数据任君挑选,但数据处理堪比在火锅里捞一根特定品牌的粉丝——你得先学会用Bioconductor工具包清洗数据,再用DESeq2做差异分析,最后还得用KEGG通路图证明你的基因不是随机蹦迪。而当我试图用“数据库太难整理”当借口时,导师微微一笑:“生物信息学的精髓,就是把抽象理论变成实用技能。”
二、导师博弈中的“生存算法”
和导师讨论方案修改,本质上是一场基于动态规划的博弈。我的策略分三步:
1.假装镇定:先点头说“这个方向很有意义”,其实内心在疯狂计算加班时长;
2.文献防御:火速搜20篇最新论文,证明我的原始设计“虽然朴素但经典”——可惜导师早有准备,反手甩出一篇《Nature》子刊:“你看,人家连单细胞测序都加上了。”
3.迂回妥协:最终达成协议:保留原分析框架,但增加拷贝数变异验证。这就像谈判后同意给汉堡加片芝士,虽然成本涨了30%,但至少不用重做整个汉堡。
关键技巧在于:把导师的“挑刺”翻译成学术需求。比如“结果不够可靠”=“需要实验验证”,“方法陈旧”=“建议引入机器学习”。毕竟生物信息学的伦理准则之一就是——让导师的批注看起来像科学建议,而不是个人偏好。
三、崩溃自救指南:当代码跑崩时
重做实验设计的那天,我的R脚本报了第14次错误。屏幕上的红色警告像肿瘤突变信号一样刺眼,而我的精神状态堪比被反复比对到不同参考基因组上的reads。这时候必须启动自救程序:
1.咖啡因疗法:实验室的浓缩咖啡液浓度,与debug成功率呈正相关;
2.同事吐槽会:和隔壁做湿实验的哥们互相安慰。他说他的细胞又污染了,我说我的p值又飘了——最后我们达成共识:科研就是互相证明“你比我惨”的过程;
3.玄学调试:把电脑桌面换成DNA双螺旋,虔诚地念叨三遍“显著性小于0.05”。
当然,真正管用的还是回归技术本质:检查数据预处理是否合理(比如过滤低质量reads像淘米一样仔细),确认差异分析参数没设错(别把FDR校正当成调味料随便撒),最后记得引物设计要避开发夹结构——否则你的PCR结果会比论文拒稿信还让人心碎。
尾声:暗黑周记的生存率曲线
现在我的修改版方案终于躺在了导师邮箱里,存活概率大概和癌症患者的五年生存率差不多。但生物信息学教会我:只要持续更新知识(比如追最新算法像追剧),保持工具库与时俱进(从Samtools到AI建模),再难的数据也能熬成一锅高汤。
至于下次导师会不会又让“再来一版”?没关系,科研人的韧性就像circRNA——没有终点,但总能闭环。